شکا کاروانسرا مربع و اندازه خارجی آن ۶۵/۹۰ x۶۵/۹۰ متر و اندازه داخلی آن ۳۵x۳۵ متر می‌باشد. اتاق‌های کاروانسرا نیز به صورت مربع به ضلع ۲/۶۵x۲/۶۵ متر بنا گردیده است.کاروانسرای یزدخواست مورد بازدید و استفاده بسیاری از جهانگردان مانند تاورنیه و مویر قرارگرفته و در قرن اخیر محققانی چون م.پ_اسمیت و ر_اتینگهاوزن کتیبه بنا را مورد بررسی قرار داده‌اند. کاروانسرای یزدخواست در دوره قاجاریه مورد تعمیر قرارگرفته و چهارده طاق‌نما در طرفین ورودی آن اضافه گردیده‌است.